Emmert erhielt ihre musikalische Ausbildung an den Musikhochschulen in Würzburg und Detmold sowie bei Marie-Claire Alain (Paris) und Russell Saunders (Rochester, USA). Aus mehreren internationalen Orgelwettbewerben ging sie als Preisträgerin hervor und war von 1993 bis 1995 als Lehrbeauftragte für Orgel an der Musikhochschule Detmold tätig. Seit 1995 unterrichtet sie Orgel an der Hochschule für Katholische Kirchenmusik in Regensburg und wurde dort 2003 zur Honorarprofessorin ernannt. Darüber hinaus geht sie einer internationalen Konzerttätigkeit als Organistin nach.